O Instituto Mamirauá possui acervos cientí­ficos e didáticos de mamíferos, répteis e peixes implementados, além de uma coleção de cultura material e outra de material arqueológico, que apresentam potencial para se transformar em acervo científico. Hoje os materiais do acervo se encontram em melhor estado de conservação e em processo de informatização para consultas e pesquisa on-line.